Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcerg1Q8CGF7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcerg1Q8CGF7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms