Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc63Q8CDV6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms