Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn5Q8CBA2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms