Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4aQ8C9S8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4aQ8C9S8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms