Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms