Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FarsaQ8C0C7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FarsaQ8C0C7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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