Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrfn5Q8BXA0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms