Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx17Q8BVL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx17Q8BVL3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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