Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms