Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap2Q8BMG7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap2Q8BMG7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap2Q8BMG7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap2Q8BMG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap2Q8BMG7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3gap2Q8BMG7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms