Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LsampQ8BLK3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LsampQ8BLK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LsampQ8BLK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms