Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp54Q8BL06 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms