Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms