Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms