Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms