Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms