Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrde2Q80XC6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrde2Q80XC6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms