Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sestd1Q80UK0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms