Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NischQ80TM9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
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