Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vma21Q78T54 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vma21Q78T54 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vma21Q78T54 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vma21Q78T54 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vma21Q78T54 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vma21Q78T54 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vma21Q78T54 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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