Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eapQ76KJ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd3eapQ76KJ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms