Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms