Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Efr3bQ6ZQ18 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Efr3bQ6ZQ18 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efr3bQ6ZQ18 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Efr3bQ6ZQ18 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms