Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms