Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rhox8Q6VSS7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rhox8Q6VSS7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms