Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc4Q6S5L9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc4Q6S5L9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms