Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpeQ6RT24 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpeQ6RT24 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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