Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bnip1Q6QD59 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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