Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms