Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med16Q6PGF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms