Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrlQ6PE55 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PdgfrlQ6PE55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfrlQ6PE55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PdgfrlQ6PE55 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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