Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dtx4Q6PDK8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms