Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zbtb39Q6PDK0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb39Q6PDK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms