Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp49Q6P9L4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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