Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms