Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt87Q6IMF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt87Q6IMF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms