Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms