Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil1Q6EDY6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil1Q6EDY6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms