Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzrn3Q69ZS0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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