Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk13Q69ZA1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms