Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg9aQ68FE2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg9aQ68FE2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms