Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltcQ68FD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms