Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CochQ62507 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CochQ62507 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CochQ62507 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CochQ62507 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CochQ62507 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CochQ62507 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CochQ62507 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CochQ62507 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms