Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtmQ62388 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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