Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ssr4Q62186 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ssr4Q62186 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ssr4Q62186 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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