Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhocQ62159 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms