Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprrQ62132 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms