Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms