Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Igbp1Q61249 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms