Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a1Q61165 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms